Riassunto
La creazione di modelli in vitro che imitano l'invasione tumorale come parte del processo metastatico è una parte fondamentale della ricerca oncologica. La necessità di incorporare più tipi di cellule, analisi cinetiche a lungo termine, metodi per consentire l’invasione 3D nella matrice circostante e rilevamento ed analisi appropriati, ha reso difficile la creazione di nuovi modelli. La procedura descritta in questa nota applicativa soddisfa queste esigenze includendo funzionalità di imaging avanzate che consentono l'acquisizione di più immagini in un intervallo di altezze z, utilizzando canali di campo chiaro e fluorescenza in modo cinetico. Le immagini finali elaborate, dopo la cucitura e la proiezione z, consentono un'analisi cellulare accurata per discernere le capacità invasive delle strutture cellulari 3D nel tempo.
Introduzione
La scoperta di farmaci oncologici ha dovuto affrontare molteplici sfide nel corso degli anni. Poiché i tumori sviluppano molteplici mutazioni durante la carcinogenesi, gli approcci mirati alle singole mutazioni genetiche comuni a molte campagne di scoperta di farmaci hanno per lo più un’efficacia limitata. Al contrario, il progresso di nuovi metodi che si concentrano sull’inibizione del fenotipo invasivo delle metastasi offre un maggiore potenziale per interventi significativi, in particolare perché la maggior parte dei pazienti affetti da cancro muore solo dopo che si sono verificate le metastasi. Affinché questo approccio funzioni, i modelli cellulari in vitro utilizzati nella scoperta precoce dei farmaci dovrebbero imitare il più fedelmente possibile il complesso processo metastatico. I tumori in vivo esistono come una massa tridimensionale (3D) di più tipi cellulari, comprese le cellule tumorali e stromali. Pertanto, l'incorporazione di una struttura cellulare di tipo sferoide 3D che include tipi di cellule co-coltivate che formano un tumoreide fornisce un modello più predittivo rispetto all'uso di singole cellule tumorali seminate in micropiastre. Un ulteriore vincolo è la necessità di esperimenti cinetici a lungo termine per catturare il processo di invasione che in genere richiede più giorni. Pertanto, è necessario il controllo ambientale del test in modo tale che la vitalità cellulare dello sferoide venga mantenuta per questo lungo periodo e gli effetti putativi del farmaco siano adeguatamente valutati. Infine, l'unica lettura adatta per monitorare l'invasione tumorale è la microscopia a causa delle piccole dimensioni dello sferoide. Per essere efficace nella scoperta di farmaci, il microscopio deve disporre di acquisizione, elaborazione ed analisi automatizzate delle immagini per essere in grado di far fronte alle molteplici condizioni di analisi, ai composti testati ed alle immagini cinetiche acquisite.
Questo lavoro dimostrerà una procedura per la generazione di strutture tumoreidi sferoidali 3D, la creazione di una matrice di invasione adeguata, il monitoraggio automatizzato basato su immagini cinetiche e l'analisi cellulare delle immagini z-stacked catturate dell'invasione tumorale
In questo studio sono state utilizzate le linee cellulari di glioblastoma multiforme (GBM) U-87 e LN-229 poiché hanno dimostrato differenze fenotipiche e capacità metastatica. In particolare, il gene PTEN che sopprime la crescita è mutato nelle cellule U-87, ma funziona normalmente in LN -229 celle. Inoltre, la proteina UL-97 della fosfotransferasi del citomegalovirus umano inibisce l'allungamento e la replicazione del DNA ed è assente nelle cellule U-87, ma presente nelle cellule LN-229.2 Ciò supporta un modello di crescita e invasione più aggressivo per le cellule U-87. Entrambi i tipi di cellule sono stati coltivati in co-coltura con fibroblasti per creare tumoreidi 3D che rappresentassero più da vicino le condizioni tumorali in vivo e hanno permesso l'invasione attraverso una matrice proteica.
La 17-allilammino-17-demetossigeldanamicina (17-AAG), nota per inibire la funzione della proteina da shock termico 90 (Hsp90), una proteina chaperone che stabilizza le proteine necessarie per la crescita del tumore, è stata utilizzata in questo caso per inibire la potenziale invasione tumorale. Quantificazione di le immagini cinetiche catturate sono state utilizzate per caratterizzare il potenziale di invasione delle colture tumoroidi inibite e non inibite.
Materiali e metodi
Materiali
Cellule
Le cellule GBM U-87 che esprimono GFP sono state generosamente donate dal Dr. Sachin Katyal (Università di Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada). Le cellule LN-229 GBM (numero di parte CRL-2611) sono state ottenute da ATCC (Manassas, VA). Fibroblasti dermici neonatali umani che esprimono RFP (codice articolo cAP-0008RFP) sono stati acquistati da Angio-Proteomie (Boston, MA).
Componenti sperimentali
La matrice della membrana basale Matrigel, priva di rosso fenolo (numero parte 356237) è stata acquistata da Corning Life Sciences (Corning, NY). L'inibitore selettivo Hsp90 17-AAG (codice articolo 1515) è stato fornito da Tocris Bioscience (Avonmouth, Bristol, Regno Unito). Il colorante CellTracker Deep Red (codice articolo C34565) è stato acquistato da Thermo Fisher Scientific (Waltham, MA). Micropiastre da 96 pozzetti, repellenti per cellule, in polistirolo, a fondo rotondo, trasparenti, sterili, con coperchio (codice articolo 650979) sono state generosamente donate da Greiner Bio-One North America, Inc. (Monroe, NC)
Lettore multimodale per imaging cellulare Agilent BioTek Cytation 5
Cytation 5 è un lettore di micropiastre multimodale modulare combinato con un microscopio digitale automatizzato. È disponibile la lettura di micropiastre basata su filtro e monocromatore e il modulo di microscopia fornisce un ingrandimento fino a 60x in fluorescenza, campo chiaro, campo chiaro a colori e contrasto di fase. Lo strumento può eseguire l'imaging in fluorescenza fino a quattro canali in un unico passaggio. Con particolare attenzione ai test su cellule vive, Cytation 5 è dotato di agitazione, controllo della temperatura fino a 65 °C, controllo del gas CO2/O2 e doppi iniettori per test cinetici ed è controllato dal lettore di micropiastre Agilent BioTek Gen5 integrato e dal software imager, che automatizza anche l'acquisizione delle immagini, analisi ed elaborazione. Lo strumento è stato utilizzato per monitorare cineticamente l'attività tumoreide 3D durante il periodo di incubazione.
Incubatore automatizzato Agilent BioTek BioSpa 8
L'incubatore automatizzato BioSpa 8 collega i lettori o gli imager Agilent BioTek con i lavatori ed i dispensatori Agilent BioTek per l'automazione completa del flusso di lavoro fino a otto micropiastre. I livelli di temperatura, CO2/O2 e umidità sono controllati e monitorati tramite il software Agilent BioTek BioSpa per mantenere un ambiente ideale per le colture cellulari durante tutte le fasi sperimentali. Le piastre di prova sono state incubate nella BioSpa per mantenere condizioni atmosferiche adeguate per un periodo di sette giorni e trasferite automaticamente al Cytation 5 ogni dodici ore per l'imaging in campo chiaro e in fluorescenza.
Erogatore multimodale Agilent BioTek MultiFlo FX
MultiFlo FX è un erogatore di reagenti modulare e aggiornabile che può avere fino a due peri-pompe (distributori da 8 tubi), due erogatori con pompa a siringa e un lavastrisce. I collettori della siringa e del dispositivo di lavaggio possono essere configurati per densità di piastre da 6 a 384 pozzetti.
Metodi
Preparazione cellulare e formazione del tumoreide
Le cellule U-87 e fibroblastiche preparate sono state raccolte e combinate in una concentrazione finale di 2,5 × 104 cellule/mL per ciascun tipo di cellula in mezzo completo. Dopo aver dispensato 100 μL di sospensione cellulare nei pozzetti appropriati della micropiastra, la micropiastra è stata incubata a 37°C/5% CO2 per 48 ore per consentire alle cellule di aggregarsi in tumoreidi. Questo processo è stato ripetuto utilizzando cellule LN-229 colorate con il colorante CellTracker Deep Red e cellule di fibroblasti alle stesse concentrazioni e volumi.
Preparazione della matrice di invasione
Una volta completata la formazione del tumoreide, 70 μL di mezzo completo sono stati rimossi roboticamente da ciascun pozzetto e la piastra tumoreide è stata posta sul ghiaccio in un frigorifero per cinque minuti per raffreddare le cellule. La matrice Matrigel è stata quindi scongelata su ghiaccio. Il 17-AAG è stato diluito a una concentrazione 2x di 20.000 nM in mezzi di invasione e utilizzato per creare una titolazione in otto punti da 20.000 nM a 0 nM utilizzando diluizioni seriali 1:4. Le titolazioni degli inibitori sono state ulteriormente diluite a una concentrazione 1x combinandole con mezzi di invasione o matrice Matrigel. Con la piastra ancora sul ghiaccio, sono stati aggiunti 70 μL di matrice Matrigel più composto titolato a ciascun pozzetto contenente tumoreidi, quindi sovrapposti con 100 μL di terreno di invasione contenente il composto titolato. La micropiastra è stata centrifugata a 300 x g per cinque minuti in una centrifuga a secchio oscillante precedentemente impostata a 4°C per il posizionamento del tumoreide, quindi trasferita in un incubatore a 37°C/5% CO2 per un'ora per avviare la formazione del gel.
Prestazioni del test di invasione tumorale
Una volta completata la formazione del gel, la micropiastra è stata trasferita a BioSpa 8, dove il software è stato programmato in modo tale che la micropiastra fosse automaticamente trasferita a Cytation 5 per l'imaging in campo chiaro e fluorescente dei pozzetti ogni dodici ore durante il periodo di incubazione di sette giorni. La tabella elenca le impostazioni utilizzate per eseguire l'acquisizione automatizzata delle immagini di ciascun pozzetto del campione.
Elaborazione delle immagini
Le singole tessere di immagine di ciascun piano z catturate utilizzando il montaggio tre per due sono state quindi unite insieme.
È stata quindi creata una singola proiezione di immagine dallo z-stack cucito a 20 sezioni. È stato scelto il metodo focus stacking, che seleziona automaticamente il pixel più a fuoco da ciascuna immagine nello stack per includerlo nella proiezione finale. Ciò consente di eseguire l'analisi più accurata su ciascun tumoreide invasore in ogni momento
Analisi dell'invasione tumorale
I criteri di analisi cellulare della maschera primaria sono stati applicati utilizzando il canale in campo chiaro per posizionare automaticamente le maschere degli oggetti attorno all'intera struttura invasiva in ciascuna immagine finale. Sono stati applicati anche criteri di analisi cellulare della maschera secondaria per posizionare una maschera aggiuntiva attorno alle cellule non invasive rimanenti all'interno della struttura tumoroide sferica originale.
Risultati e discussione
Elaborazione delle immagini grezze prima dell'analisi cellulare
Durante il periodo di incubazione di sette giorni, disinibito, i tumoreidi U-87/fibroblasti hanno continuato ad aumentare di dimensioni, oltre a invadere la matrice proteica. Per garantire che l'intera struttura invasiva, inclusa l'invadopodia, fosse catturata negli assi X e Y, indipendentemente dalle dimensioni, sono state scattate più immagini su un singolo piano z in un formato di montaggio. La figura illustra quattro delle sei immagini catturate contenenti porzioni della struttura invasore.
Man mano che l’invasione procede, le proteine e le cellule invadono su più piani all’interno dell’asse Z. Pertanto, le immagini sono state scattate automaticamente su una gamma di altezze z in modo che tutte le parti della struttura complessiva fossero a fuoco nelle immagini proiettate z finali.
Osservando il segnale fluorescente emesso da ciascun tipo di cellula in co-coltura, rispetto al segnale in campo chiaro dell'intera struttura, è possibile osservare la migrazione delle singole cellule. Nel caso del modello U-87/fibroblasto, l'immagine in campo chiaro dimostra un'estesa invadopodia che si estende dal tumoreide propagante originale. Dall'immagine GFP, è evidente che le cellule U-87 che esprimono GFP seguono l'invasione dell'invadopodia nella matrice. Ciò contrasta con l'immagine RFP, confermando che i fibroblasti che esprimono RFP mostrano poca o nessuna capacità migratoria all'interno di questo modello sperimentale.
Acquisizione di immagini cinetiche
Infine, le immagini proiettate su z vengono catturate cineticamente ogni 12 ore per osservare i cambiamenti fenotipici nei
Tumorioidi co-coltivati U-87/fibroblasti dopo il trattamento con concentrazioni variabili di 17-AAG. I tumoreidi disinibiti, come previsto, dimostrano una natura altamente invasiva, esibendo un aumento delle dimensioni del corpo tumoroide e un drammatico aumento dell'invadopodia.
Analisi tumoreide LN-229/fibroblasti
Anche l'imaging tumoreide LN-229/fibroblasto è stato condotto nello stesso modo di quello per i tumoreidi U-87/fibroblasto. Ciò è stato fatto per confrontare le differenze nella crescita e nella produzione di invadopodia tra i tipi di cellule GBM noti per essere altamente invasivi (U-87) e quelli con capacità meno invasiva (LN-229).5 I cambiamenti nella struttura 3D completa sono stati osservati utilizzando il campo chiaro sovrapposto e immagini fluorescenti, mentre l'invasione individuale di LN-229 o fibroblasti è stata monitorata dal segnale catturato rispettivamente con i singoli canali CY5 o RFP.
Confrontando le immagini cinetiche in campo chiaro dei due tipi di cellule in co-coltura, è evidente che i tumoreidi LN-229/fibroblasti si propagano nel tempo, come si vede dall'aumento delle dimensioni dello sferoide, ma non mostrano le proprietà invasive chiaramente dimostrate dall'U-87 /tumoreidi fibroblasti nello stesso periodo di incubazione.
Analisi cellulare Agilent BioTek Gen5 basata su Image+ dell'invasione tumorale
Oltre alle valutazioni qualitative dei cambiamenti fenotipici tumoroidi, è stata effettuata anche la quantificazione dell'entità dell'invasione utilizzando le immagini in campo chiaro proiettate su z. Sono state eseguite due analisi cellulari separate dopo il trattamento con la titolazione 17-AAG. Nel primo, le funzionalità di analisi cellulare primaria disponibili in Gen5 Image+ ed i criteri elencati hanno utilizzato i cambiamenti nel segnale in campo chiaro all'interno dell'immagine tra i pixel contenenti il cellulare e lo sfondo per posizionare maschere di oggetti dettagliate attorno all'intera struttura 3D invasiva, nonostante il livello del trattamento composto.
È stata quindi calcolata l'area coperta dall'intero tumoreide per ciascuna immagine catturata nel tempo. I valori dei punti temporali successivi sono stati quindi divisi per il valore dell'area calcolato al tempo 0 per il tumoreide specifico per normalizzare i risultati e tenere conto della variabilità nella dimensione del tumoreide in seguito alla dispensazione e all'aggregazione delle cellule. Sono stati quindi tracciati i rapporti delle aree (asse Y) rispetto al tempo (asse X).
Dai risultati visualizzati, è evidente che sia i tumoreidi U-87/fibroblasto che quelli LN-229/fibroblasto si propagano all'interno della matrice Matrigel quando senza ostacoli durante il periodo di incubazione di sette giorni. Si può anche vedere che il composto 17-AAG è in grado di limitare, o addirittura arrestare completamente, la crescita del tumoreide in modo dose-dipendente, come previsto. Ciò che risulta chiaro anche dai grafici del rapporto dell'area totale è l'aumento del tasso di crescita per la struttura 3D completa esibita dai tumoreidi U-87/fibroblasti rispetto a quelli in cui le cellule LN-229 sono co-coltivate con fibroblasti. Gli aumenti nell'area coperta dall'intero tumoreide sono circa 2 volte nel tempo per i tumoreidi coltivati con cellule U-87 (rapporto: 4,4) rispetto a quelli coltivati con cellule LN-229 (rapporto: 2,4).
Analisi cellulare basata su Agilent BioTek Gen5
Image Prime dell'invasione tumorale
È stata eseguita anche una seconda analisi cellulare utilizzando le funzionalità di analisi cellulare primaria e secondaria disponibili in Gen5 Image Prime ed i criteri elencati, per misurare l'area coperta esclusivamente da cellule non invasive all'interno del tumoreide. Per determinare la capacità metastatica dei modelli 3D in vitro, sia non inibiti, sia dopo trattamento, è importante distinguere tra l'area coperta dalle cellule all'interno del tumoreide originale e quella coperta dagli invadopodi. Poiché le cellule non invasive più densamente concentrate ed in propagazione appaiono più scure rispetto all'invadopodia in un'immagine in campo chiaro (Figura 1A), questo ulteriore cambiamento nel segnale all'interno della maschera originale consente il posizionamento di una maschera secondaria per escludere le aree invasori di ciascun tumoreide e separare l'area coperti dalle due porzioni dell'intera struttura 3D (Figura 1).
Applicando la maschera secondaria attorno alle porzioni non invasive del tumoreide, le differenze nelle qualità invasive dei due tipi di cellule GBM diventano quindi chiare.
L'area coperta da invadopodia per i tumoreidi U-87/fibroblasti aumenta notevolmente durante il periodo di incubazione di sette giorni. I tumoreidi LN-229/fibroblasti, in confronto, mostrano un piccolo aumento dell'invadopodia nello stesso tempo. Questa doppia analisi, quindi, ha il potenziale per determinare non solo la rapidità con cui le cellule tumoroidi si stanno propagando, ma anche la natura invasiva del modello cellulare
Conclusione
L'applicazione di funzionalità avanzate di imaging cellulare, come l'acquisizione di più immagini su un singolo piano z così come in uno stack z, consente di catturare a fuoco tutte le porzioni di una struttura tumoroide cellulare 3D invasore. Una volta cuciti e proiettati su un'immagine finale, è possibile eseguire un'analisi accurata. La capacità di visualizzare interi tumoreidi tramite imaging in campo chiaro, nonché singoli tipi di cellule tramite imaging fluorescente, consente inoltre di determinare le proprietà invasive di ciascun tipo di cellula co-coltivata all'interno del modello cellulare incluso. L'inclusione dell'analisi cellulare senza etichetta, effettuata su immagini in campo chiaro, può quindi quantificare non solo le qualità propagative, ma anche la specifica natura invasiva dei modelli cellulari 3D in vitro quando non inibiti ed in risposta alle molecole test.
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