L'invecchiamento altera le reti di splicing dell'RNA nel corpo umano / Aging Alters RNA Splicing Networks Across the Human Body

L'invecchiamento altera le reti di splicing dell'RNA nel corpo umano / Aging Alters RNA Splicing Networks Across the Human Body

Segnalato dal Dott. Giuseppe Cotellessa / Reported by Dr. Giuseppe Cotellessa

I geni coinvolti nello splicing e nell'elaborazione dell'RNA mostrano cambiamenti correlati all'età comuni in diversi tessuti umani.

 Il 22 dicembre 2025 è stato pubblicato un nuovo articolo di ricerca, pubblicato sulla copertina del  volume 17, numero 12 di  Aging-US , intitolato " Una combinazione di analisi di espressione differenziale e connettività di rete identifica un insieme comune di geni di splicing e di elaborazione dell'RNA alterati con l'età nei tessuti umani ".

In questo studio, condotto da Caio MPF Batalha dell'Università  di San Paolo, André Fujita dell'Università  di San Paolo  e  dell'Università di Kyushu, e Nadja C. de Souza-Pinto, anch'essa dell'Università  di San Paolo,  i ricercatori hanno studiato come l'attività genica cambi con l'età in diversi tessuti umani. Hanno scoperto che molti tessuti condividono alterazioni comuni legate all'invecchiamento nei geni coinvolti nello splicing e nell'elaborazione dell'RNA. Questi risultati sono importanti perché l'elaborazione dell'RNA è essenziale per un'accurata produzione proteica e le interruzioni in questo processo sono collegate all'invecchiamento ed alle malattie.

L'invecchiamento colpisce tutti i tessuti, ma identificare i cambiamenti molecolari condivisi in tutto il corpo è rimasto difficile. Per affrontare questo problema, i ricercatori sono andati oltre gli approcci tradizionali che si concentrano esclusivamente sui cambiamenti nei livelli di espressione genica. Hanno anche analizzato come i geni alterano i loro modelli di interazione all'interno delle reti regolatorie, catturando i cambiamenti legati all'età che non sono evidenti dai soli dati di espressione.

I dati sull'espressione genica (in TPM – trascrizioni per milione) sono stati ottenuti dal progetto Genotype-Tissue Expression (GTEx).

Utilizzando i dati di sequenziamento dell'RNA di quasi mille donatori umani di età compresa tra 20 e 70 anni, il gruppo di ricerca ha analizzato otto tessuti, tra cui sangue, cervello, cuore, pelle e muscoli. I risultati hanno mostrato che molti cambiamenti legati all'invecchiamento diventano evidenti solo quando si considera il comportamento della rete genica. Analizzando insieme l'espressione genica e la connettività della rete, è emerso un gruppo coerente di geni nei tessuti, la maggior parte dei quali era legata allo splicing ed all'elaborazione dell'RNA, fasi chiave nella produzione di proteine ​​funzionali.

Lo studio ha anche rivelato che questi geni correlati all'RNA sono altamente interconnessi a livello proteico. Molti di essi formano complessi proteici noti, inclusi componenti dello spliceosoma, che svolge un ruolo centrale nella maturazione dell'RNA. Con l'età, le interazioni tra questi geni tendono a riorganizzarsi in modo simile nei vari tessuti, indicando una risposta biologica condivisa piuttosto che effetti indipendenti e tessuto-specifici.

Oltre all'elaborazione dell'RNA, i ricercatori hanno osservato cambiamenti legati all'età nei percorsi coinvolti nella gestione degli RNA e delle proteine ​​danneggiati, tra cui la degradazione proteica, l'autofagia ed i meccanismi di risposta al danno al DNA. Questi percorsi supportano il controllo di qualità cellulare e contribuiscono a limitare l'accumulo di errori molecolari che aumentano con l'età.

Nel complesso, questo studio identifica lo splicing e l'elaborazione dell'RNA come caratteristiche centrali e conservate dell'invecchiamento umano nei vari tessuti. Dimostra inoltre che gli approcci basati sulla rete forniscono una visione più completa del trascrittoma dell'invecchiamento, offrendo nuove prospettive sui cambiamenti biologici legati all'età e potenziali direzioni per la ricerca sull'invecchiamento.

ENGLISH

RNA splicing and processing genes show shared age-related changes across multiple human tissues.

A new research paper featured as the cover of Volume 17, Issue 12 of Aging-US was published on December 22, 2025, titled “A combination of differential expression and network connectivity analyses identifies a common set of RNA splicing and processing genes altered with age across human tissues.”

In this study by Caio M.P.F. Batalha from the University of São Paulo, André Fujita from the University of São Paulo and Kyushu University, and Nadja C. de Souza-Pinto also from the University of São Paulo, researchers investigated how gene activity changes with age across multiple human tissues. They found that many tissues share common aging-related alterations in genes involved in RNA splicing and RNA processing. These findings are important because RNA processing is essential for accurate protein production, and disruptions in this process are linked to aging and disease.

Aging affects all tissues, yet identifying molecular changes that are shared across the body has remained challenging. To address this, researchers moved beyond traditional approaches that focus exclusively on changes in gene expression levels. They also analyzed how genes alter their patterns of interaction within regulatory networks, capturing age-related changes that are not evident from expression data alone.

“Gene expression data (in TPM – transcripts per million) were obtained from the Genotype-Tissue Expression (GTEx) project.”

Using RNA sequencing data from nearly one thousand human donors aged 20 to 70, the research team analyzed eight tissues, including blood, brain, heart, skin, and muscle. The results showed that many aging-related changes become evident only when gene network behavior is considered. When gene expression and network connectivity were analyzed together, a consistent group of genes emerged across tissues, most of which were linked to RNA splicing and RNA processing, key steps in the production of functional proteins.

The study also revealed that these RNA-related genes are highly interconnected at the protein level. Many of them form known protein complexes, including components of the spliceosome, which plays a central role in RNA maturation. With age, the interactions among these genes tend to reorganize in similar ways across tissues, pointing to a shared biological response rather than independent, tissue-specific effects.

In addition to RNA processing, the researchers observed age-related changes in pathways involved in managing damaged RNAs and proteins, including protein degradation, autophagy, and DNA damage response mechanisms. These pathways support cellular quality control and help limit the accumulation of molecular errors that increase with age.

Overall, this study identifies RNA splicing and RNA processing as central, conserved features of human aging across tissues. It also demonstrates that network-based approaches provide a more complete view of the aging transcriptome, offering new insights into age-related biological changes and potential directions for aging research.

Da:

https://www.technologynetworks.com/proteomics/news/aging-alters-rna-splicing-networks-across-the-human-body-408317