Recurrent Mutations in SARS-CoV-2 Doesn’t Increase Transmissibility / Mutazioni ricorrenti in SARS-CoV-2 non aumentano la trasmissibilità.

Recurrent Mutations in SARS-CoV-2 Doesn’t Increase Transmissibility /   Mutazioni ricorrenti in SARS-CoV-2 non aumentano la trasmissibilità.

Segnalato dal Dott. Giuseppe Cotellessa /  Reported by Dr. Giuseppe Cotellessa

Researchers at University College London carried out a large study that suggests that none of the recorded mutations in SARS-CoV-2 increase its transmissibility, contrary to claims from other researchers.

Viruses all mutate over time, but some do this faster than others. Coronaviruses, however, actually have a slower rate of mutation than viruses like influenza or HIV, as they have an inbuilt enzyme that corrects ‘proofreading’ errors in the RNA when the virus replicates.

Despite this, there has been much debate and concern about whether mutations in the SARS-CoV-2 virus could make it more transmissible or more pathogenic. So far, no recorded mutations seem to have increased pathogenicity, but some research has suggested that mutations—particularly D614G—have increased the speed that the virus has spread.

“The number of SARS-CoV-2 genomes being generated for scientific research is staggering. We realized early on in the pandemic that we needed new approaches to analyze enormous amounts of data in close to real time to flag new mutations in the virus that could affect its transmission or symptom severity,” said Lucy van Dorp, PhD, a senior researcher at the UCL Genetics Institute and first author of “No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2“, published by Nature Communications.

The researchers analyzed genomic data collected from 46,723 viral samples from people with COVID-19 from 99 countries. They used bioinformatic tools to assess viral phylogenies and evaluate whether any variants occurred more often than would be expected by chance.

“Fortunately, we found that none of these mutations are making COVID-19 spread more rapidly, but we need to remain vigilant and continue monitoring new mutations, particularly as vaccines get rolled out,” said van Dorp.

The team detected a total of 12,706 mutations across the 46,723 viral genomes, many of which were cytosine to uracil base changes. Of these, 398 were recurrent mutations that were candidates for increasing transmission, but they found no evidence that any of these mutations actually increased the spread of the virus including the D614G variant.

The researchers found that overall genetic variation across the viral samples was moderate, with an average difference of 8.4 single nucleotide polymorphisms between samples. “This low number of mutations between any two viruses currently in circulation means that, to date, we believe SARS-CoV-2 can be considered as a single lineage, notwithstanding taxonomic efforts to categorize extant diversity into sublineages,” write the authors.

van Dorp and colleagues welcome the recent positive news about the SARS-CoV-2 vaccines that are almost ready to be released for use. However, they caution that widespread vaccine use may exert an evolutionary pressure on the virus to become resistant.

“The virus may well acquire vaccine-escape mutations in the future, but we’re confident we’ll be able to flag them up promptly, which would allow updating the vaccines in time if required,” says François Balloux, PhD, a professor at UCL Genetics Institute and senior author on the study.

ITALIANO

I ricercatori dell'University College di Londra hanno condotto un ampio studio che suggerisce che nessuna delle mutazioni registrate in SARS-CoV-2 ne aumenta la trasmissibilità, contrariamente a quanto affermato da altri ricercatori.

Tutti i virus mutano nel tempo, ma alcuni lo fanno più velocemente di altri. I coronavirus, tuttavia, in realtà hanno un tasso di mutazione più lento rispetto a virus come l'influenza o l'HIV, poiché hanno un enzima integrato che corregge gli errori di "correzione di bozze" nell'RNA quando il virus si replica.

Nonostante ciò, c'è stato molto dibattito e preoccupazione sul fatto che le mutazioni nel virus SARS-CoV-2 potessero renderlo più trasmissibile o più patogeno. Finora, nessuna mutazione registrata sembra aver aumentato la patogenicità, ma alcune ricerche hanno suggerito che le mutazioni, in particolare D614G, hanno aumentato la velocità di diffusione del virus.

“Il numero di genomi SARS-CoV-2 generati per la ricerca scientifica è sbalorditivo. Ci siamo resi conto sin dall'inizio della pandemia che avevamo bisogno di nuovi approcci per analizzare enormi quantità di dati quasi in tempo reale per segnalare nuove mutazioni nel virus che potrebbero influenzarne la trasmissione o la gravità dei sintomi ", ha affermato Lucy van Dorp, PhD, ricercatrice senior presso l'UCL Genetics Institute e primo autore di " Nessuna prova per una maggiore trasmissibilità da mutazioni ricorrenti in SARS-CoV-2 ", pubblicato da Nature Communications .

I ricercatori hanno analizzato i dati genomici raccolti da 46.723 campioni virali di persone con COVID-19 provenienti da 99 paesi. Hanno utilizzato strumenti bioinformatici per valutare le filogenesi virali e valutare se eventuali varianti si sono verificate più spesso di quanto ci si aspetterebbe per caso.

"Fortunatamente, abbiamo scoperto che nessuna di queste mutazioni sta facendo diffondere il COVID-19 più rapidamente, ma dobbiamo rimanere vigili e continuare a monitorare le nuove mutazioni, in particolare quando i vaccini vengono lanciati", ha detto van Dorp.

Il gruppo ha rilevato un totale di 12.706 mutazioni nei 46.723 genomi virali, molte delle quali da citosina a cambiamenti di base dell'uracile. Di queste, 398 erano mutazioni ricorrenti che erano candidate per aumentare la trasmissione, ma non hanno trovato prove che nessuna di queste mutazioni aumentasse effettivamente la diffusione del virus, inclusa la variante D614G.

I ricercatori hanno scoperto che la variazione genetica complessiva tra i campioni virali era moderata, con una differenza media di 8,4 polimorfismi a singolo nucleotide tra i campioni. "Questo basso numero di mutazioni tra due virus qualsiasi attualmente in circolazione significa che, ad oggi, crediamo che SARS-CoV-2 possa essere considerato come un unico lignaggio, nonostante gli sforzi tassonomici per classificare la diversità esistente in sottofine", scrivono gli autori.

Van Dorp e colleghi accolgono con favore le recenti notizie positive sui vaccini SARS-CoV-2 che sono quasi pronti per essere rilasciati per l'uso. Tuttavia, avvertono che l'uso diffuso del vaccino può esercitare una pressione evolutiva sul virus affinché diventi resistente.

"Il virus potrebbe acquisire mutazioni che sfuggono al vaccino in futuro, ma siamo fiduciosi che saremo in grado di segnalarle prontamente, il che consentirebbe di aggiornare i vaccini in tempo se necessario", afferma François Balloux, PhD, un professore presso l'UCL Genetics Institute ed autore senior dello studio.

Da:

https://www.genengnews.com/news/recurrent-mutations-in-sars-cov-2-doesnt-increase-transmissibility/?fbclid=IwAR0i4wgdblygR_pWd5NWDcAgJxg3Fuc0d0L8qsdasqY3_VinEjVa7TGT21M