GeoMx® Workflow / Flusso di lavoro di GeoMx®

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 GeoMx® Workflow / Flusso di lavoro di GeoMx®


Segnalato dal Dott. Giuseppe Cotellessa / Reported by Dr. Giuseppe Cotellessa



Canopy Biosciences®, a Bruker company, empowers innovation by providing access to cutting-edge spatial biology and multi-omic tools so biomedical researchers can drive scientific discovery faster. We offer custom services for gene expression profiling, including Illumina® RNA-Seq Assays, NanoString® GeoMx® Digital Spatial Profiling and nCounter® Assays. As a CLIA-certified laboratory, we also provide support for preclinical and clinical trial studies with IHC, FISH and histopathology services.

1) Project Documentation Submission
 
A sample submission guide, sample key, and project questionnaire align study and workflow goals and ensure project success from day one.

2)  Sample Submission
 
Customers ship FFPE blocks or fresh cut slide samples to Canopy’s state-of-the-art, CLIA-certified CRO laboratory and Canopy initiates staining with standard or custom morphology markers.

3)  ROI Selection

Following morphology marker staining, a Canopy expert consults with the customer via live videoconference to select regions of interest (ROIs) for downstream molecular profiling; ROIs provide the spatial context to downstream analysis.

4) Wet Lab Workflow

Canopy initiates a validated, precise, and rigorous workflow— including probe cleavage and oligo collection, dispensing, and counting—to gather high-plex spatial proteomics and transcriptomics data.

5)  Data Sharing and Consultation

A Canopy scientist engages in a live, hour-long data review with the customer to share QC results, provide an overview of the Analysis Suite data software, and offer general consultation and guidance.

6) Customer Data Analysis

The data software tutorial and assistance from Canopy’s team allow the customer to initiate their own analysis of their data, getting the most out of this in-depth assay.

ITALIANO

Canopy Biosciences®, un'azienda Bruker, potenzia l'innovazione fornendo accesso a strumenti di biologia spaziale e multi-omici all'avanguardia in modo che i ricercatori biomedici possano guidare più rapidamente la scoperta scientifica. Offriamo servizi personalizzati per la profilazione dell'espressione genica, inclusi i saggi Illumina® RNA-Seq, NanoString® GeoMx® Digital Spatial Profiling e nCounter® Assays. In qualità di laboratorio certificato CLIA, forniamo anche supporto per studi preclinici e di sperimentazione clinica con servizi di IHC, FISH e istopatologia.

1) Presentazione della documentazione di progetto
 
Una guida all'invio di esempio, una chiave di esempio e un questionario di progetto allineano gli obiettivi dello studio e del flusso di lavoro e garantiscono il successo del progetto sin dal primo giorno.

2) Presentazione del campione
 
I clienti spediscono blocchi FFPE o campioni di vetrini tagliati da poco al laboratorio CRO all'avanguardia e certificato CLIA di Canopy e Canopy inizia la colorazione con marcatori morfologici standard o personalizzati.

3) Selezione del ROI

Dopo la colorazione del marker morfologico, un esperto di Canopy consulta il cliente tramite videoconferenza dal vivo per selezionare le regioni di interesse (ROI) per la profilazione molecolare a valle; Le ROI forniscono il contesto spaziale per l'analisi a valle.

4) Flusso di lavoro in laboratorio umido

Canopy avvia un flusso di lavoro convalidato, preciso e rigoroso, che include la scissione della sonda e la raccolta, l'erogazione e il conteggio degli oligo, per raccogliere dati di proteomica spaziale e trascrittomica ad alto plex.

5) Condivisione e consultazione dei dati

Uno scienziato Canopy si impegna in una revisione dei dati in tempo reale della durata di un'ora con il cliente per condividere i risultati del controllo qualità, fornire una panoramica del software di dati Analysis Suite e offrire consulenza e guida generali.

6) Analisi dei dati dei clienti

Il tutorial sul software dei dati e l'assistenza del team di Canopy consentono al cliente di avviare la propria analisi dei propri dati, ottenendo il massimo da questo test approfondito.

Da:

https://offers.the-scientist.com/hubfs/TS_PPL_Canopy_Custom_Poster/44348_TS_Canopy_Biosciences_GeoMx_Poster_final_updated.pdf?hsCtaTracking=5fa5d05e-8ba1-45a7-ac28-c7cdb3463f4e%7C6ba8c9b5-3505-4bb8-9378-ad401b3a759f



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