Ottimizzazione del recupero del DNA microbico per il sequenziamento 16S / Optimizing Recovery of Microbial DNA for 16S Sequencing
Ottimizzazione del recupero del DNA microbico per il sequenziamento 16S / Optimizing Recovery of Microbial DNA for 16S Sequencing
Segnalato dal Dott. Giuseppe Cotellessa / Reported by Dr. Giuseppe Cotellessa
Il microbioma influenza quasi tutte le funzioni omeostatiche quotidiane in tutti gli esseri viventi. Tuttavia, la portata e la complessità di questa relazione negli esseri umani non sono ancora del tutto comprese e richiedono ricerche più approfondite.
Gran parte di questa ricerca viene eseguita tramite sequenziamento 16S, utilizzando campioni derivati da feci. Sebbene questi campioni siano facili da raccogliere, pongono molteplici sfide per la preparazione del campione e possono dare origine a dati inaccurati e fuorvianti.
Questo esplora le tecniche per una preparazione efficace dei campioni, inclusa la selezione del mezzo di coltura ottimale e come ottenere la completa lisi del campione ed il recupero del DNA sia in campioni liquidi che solidi.
Questo per scoprire:
- Come recuperare grandi quantità di DNA ad alta integrità
- Considerazioni sulla selezione delle migliori perle per la lisi totale
- Come combinare la preparazione del campione con l'estrazione automatizzata del DNA
The microbiome affects almost all daily homeostatic functions in all living things. However, the magnitude and complexity of this relationship in humans is still not fully understood and requires more in-depth research.
Much of this research is performed through 16S sequencing, using samples derived from stool. Although these samples are easy to collect, they pose multiple challenges for sample preparation and can result in inaccurate and misrepresentative data.
This explores techniques for effective sample preparation, including selecting the optimal bead media and how to achieve full sample lysis and DNA recovery in both liquid and solid samples.
This to discover:
- How to recover high quantities of high integrity DNA
- Considerations when selecting the best beads for total lysis
- How to combine sample preparation with automated DNA extraction
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